科普|《菌物学报》发布云南菌视界“金耳菌菌株鉴别标记”新成果

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近日,云南菌视界在《菌物学报》首发论文《基于基因组重测序开发橙白耳包革(金耳菌)菌株的鉴别标记》,通过基因组测序技术,成功开发出橙白耳包革(金耳菌)菌株的鉴别标记,为金耳菌品种鉴定和知识产权保护提供了有力支持。


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《菌物学报》月刊英文刊名Mycosystema,1982年创刊,由中国科学院微生物研究所和中国菌物学会联合主办,主要刊登我国菌物学(包括真菌、黏菌、卵菌)研究领域在理论上和实践上的最新研究成果。在CNKI《中国学术期刊影响因子年报》中最新影响因子3.392;在《科技期刊世界影响力指数(WJCI)报告》中世界影响因子2.396;入选“2024中国最具国际影响力学术期刊”。


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据介绍,金耳菌是我国重要的食用菌品种,具有营养丰富、口感鲜美等特点,深受消费者喜爱。然而,由于金耳菌品种繁多,品种鉴定一直是产业发展中的难题。近年来,随着基因组测序技术的快速发展,基因组测序在食用菌品种鉴定中的应用也越来越广泛。


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近年来,云南农业大学李荣春教授带领云南菌视界团队针对金耳菌品种鉴定难题,以橙白耳包革(金耳菌)单孢菌株NX-20基因组为参考基因组,以4个不同型单孢菌株D13、D25、D40和D47基因组重测序数据为研究对象,利用生物信息学软件鉴定出大量的SNP和InDel变异位点,并分析其特征。目前已取得以下主要研究成果:


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设计SNP/InDel标记引物:研究团队使用primer5.0软件设计了一系列SNP和InDel标记引物,筛选出8对存在多态性差异的SNP标记引物和6对InDel标记引物。


  遗传多样性分析:研究团队将筛选出的标记引物应用于我国金耳栽培产业中广泛使用的14个金耳菌菌株,进行遗传多样性分析。结果显示,J2F1菌株在8对SNP引物中均形成2种基因型,其他菌株仅有一种基因型;6对InDel标记引物分析结果显示,J2F1菌株在第1、2及第5对引物中能扩增出不同于其他菌株的条带,大部分菌株能扩增出一致的条带,显示出同种异名现象。

  分子标记应用前景:研究团队筛选得到的SNP和InDel标记可进一步用于金耳菌遗传分析,为金耳菌遗传多样性、种质资源鉴定和保护及分子辅助育种等研究助力。

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围绕云南野生菌种质资源开发和食用菌运用,云南菌视界秉承科技创新理念,与中国科学院微生物研究所、上海农科院食用菌研究所、中国药科大学等多家科研院所展开合作,助力中国食用菌的发展。此次研究成果的发表,彰显了云南菌视界在食用菌基因组学研究领域的实力。随着基因组测序技术在食用菌品种鉴定中的应用,将为我国食用菌产业的蓬勃发展提供强有力的科技支撑。


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来源:云南网(记者 王永刚)

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